NONCODE TRANSCRIPT ID NONHSAT259937.1
NONCODE Gene ID NONHSAG055075.2
Chromosome chrX
Start Site 107894596
End Site 107936122
Strand -
Exon Number 4
CNCI Score -0.6433850
Length 2232
Assembly hg38
Other transcript Versions None
Sequence
>NONHSAT259937.1
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Expression Profile(Data Source:Human Body Map ) adipose adrenal brain brain_R breast colon 0 0 0.403135 0 0 0 foreskin heart heart_R HLF_1 HLF_2 kidney 0 0 0 0 0.225038 0 liver liver_R lung lymphNode ovary placenta_R 0 0 0 0 0.56527 0 prostate skeltalMuscle testes testes_R thyroid whiteBloodCell 0 0 0 0 1.18044 0
Expression profile of NONHSAT259937 in Human tissues
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Exosome Expression Profile(Data Source: NCBI GEO ) NAStructure Visualization No structure predicted!
DataSource: show detail information
See experimental data visualization in DMS dataset or PARS dataset
The following is the detail information of RNA secondary structure predicttion.
We use software RME to predict RNA Second Structure.
We select two datasets respectively from PARS and DMS-seq to predict. However, it only predicted minority RNA secondary structures through dataset correction with the limitation of sequencing data coverage. So many transcripts only have RNA secondary structure information predicted without experimental data. If the transcript do have sequencing data covered, you can switch "DataSource" to see the RNA secondary structure predicted based on different datasets.
We use forna to show the result. The color just correspond to the predicted structure and has no relation to experimental data.
If you want more detail infomation of RNA secondary structure of this transcript, please visit website http://RNAex.ncrnalab.org/
Isoforms